MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus toyonensis BCT-7112 plasmid pBCT8

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022783	ATT	2	6	705	710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624505
2	NC_022783	TAT	2	6	716	721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624505
3	NC_022783	GTATAT	2	12	734	745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	557624505
4	NC_022783	T	9	9	747	755	0 %	100 %	0 %	0 %	557624505
5	NC_022783	ATAAA	2	10	770	779	80 %	20 %	0 %	0 %	557624505
6	NC_022783	A	6	6	867	872	100 %	0 %	0 %	0 %	557624505
7	NC_022783	AAC	2	6	915	920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624505
8	NC_022783	A	8	8	928	935	100 %	0 %	0 %	0 %	557624505
9	NC_022783	TAT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624505
10	NC_022783	ATA	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624505
11	NC_022783	AT	3	6	1053	1058	50 %	50 %	0 %	0 %	557624505
12	NC_022783	CTA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624505
13	NC_022783	GAATT	2	10	1501	1510	40 %	40 %	20 %	0 %	557624506
14	NC_022783	ATT	2	6	1515	1520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624506
15	NC_022783	AACA	2	8	1543	1550	75 %	0 %	0 %	25 %	557624506
16	NC_022783	AATA	2	8	1567	1574	75 %	25 %	0 %	0 %	557624506
17	NC_022783	TTA	2	6	1601	1606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624506
18	NC_022783	AAAG	2	8	1639	1646	75 %	0 %	25 %	0 %	557624506
19	NC_022783	TCC	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557624506
20	NC_022783	TTA	2	6	1693	1698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624506
21	NC_022783	CAA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
22	NC_022783	GAA	2	6	2028	2033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557624507
23	NC_022783	A	7	7	2040	2046	100 %	0 %	0 %	0 %	557624507
24	NC_022783	T	6	6	2096	2101	0 %	100 %	0 %	0 %	557624507
25	NC_022783	CAA	2	6	2109	2114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
26	NC_022783	CAAA	2	8	2199	2206	75 %	0 %	0 %	25 %	557624507
27	NC_022783	ATT	2	6	2211	2216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624507
28	NC_022783	CTC	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557624507
29	NC_022783	AAG	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557624507
30	NC_022783	AAC	2	6	2270	2275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
31	NC_022783	ACA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
32	NC_022783	TAGA	2	8	2332	2339	50 %	25 %	25 %	0 %	557624507
33	NC_022783	TTG	2	6	2341	2346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557624507
34	NC_022783	A	6	6	2370	2375	100 %	0 %	0 %	0 %	557624507
35	NC_022783	GAA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557624507
36	NC_022783	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	557624507
37	NC_022783	CAA	2	6	2529	2534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624507
38	NC_022783	A	7	7	2533	2539	100 %	0 %	0 %	0 %	557624507
39	NC_022783	GTG	2	6	2540	2545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557624507
40	NC_022783	TAA	2	6	3267	3272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624508
41	NC_022783	TCTT	2	8	3273	3280	0 %	75 %	0 %	25 %	557624508
42	NC_022783	A	6	6	3311	3316	100 %	0 %	0 %	0 %	557624508
43	NC_022783	ATA	2	6	3361	3366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624508
44	NC_022783	TTA	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624508
45	NC_022783	TTA	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624508
46	NC_022783	A	6	6	3431	3436	100 %	0 %	0 %	0 %	557624508
47	NC_022783	A	6	6	3460	3465	100 %	0 %	0 %	0 %	557624508
48	NC_022783	ACT	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624508
49	NC_022783	T	8	8	3478	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	557624508
50	NC_022783	CTTAAT	2	12	3486	3497	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	557624508
51	NC_022783	T	8	8	3500	3507	0 %	100 %	0 %	0 %	557624508
52	NC_022783	TCT	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624508
53	NC_022783	TTA	2	6	3524	3529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557624508
54	NC_022783	TCA	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624508
55	NC_022783	TA	4	8	3548	3555	50 %	50 %	0 %	0 %	557624508
56	NC_022783	AAT	2	6	3564	3569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624508
57	NC_022783	T	6	6	3638	3643	0 %	100 %	0 %	0 %	557624508
58	NC_022783	GTT	2	6	3683	3688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557624508
59	NC_022783	TAA	2	6	3702	3707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624508
60	NC_022783	ATAA	2	8	4329	4336	75 %	25 %	0 %	0 %	557624509
61	NC_022783	T	6	6	4351	4356	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
62	NC_022783	AAC	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624509
63	NC_022783	ATA	2	6	4445	4450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624509
64	NC_022783	TCC	2	6	4485	4490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557624509
65	NC_022783	CAT	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624509
66	NC_022783	CTTT	2	8	4533	4540	0 %	75 %	0 %	25 %	557624509
67	NC_022783	CT	4	8	4568	4575	0 %	50 %	0 %	50 %	557624509
68	NC_022783	TGC	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557624509
69	NC_022783	TCATTA	2	12	4631	4642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	557624509
70	NC_022783	T	7	7	4646	4652	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
71	NC_022783	AAT	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557624509
72	NC_022783	AAG	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557624509
73	NC_022783	T	6	6	4795	4800	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
74	NC_022783	T	6	6	4802	4807	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
75	NC_022783	TTC	2	6	4819	4824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624509
76	NC_022783	CTTA	2	8	4837	4844	25 %	50 %	0 %	25 %	557624509
77	NC_022783	TCT	3	9	4868	4876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624509
78	NC_022783	ACC	2	6	4882	4887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557624509
79	NC_022783	TCTT	2	8	4927	4934	0 %	75 %	0 %	25 %	557624509
80	NC_022783	T	7	7	4940	4946	0 %	100 %	0 %	0 %	557624509
81	NC_022783	TC	3	6	5215	5220	0 %	50 %	0 %	50 %	557624510
82	NC_022783	T	6	6	5313	5318	0 %	100 %	0 %	0 %	557624510
83	NC_022783	TA	3	6	5325	5330	50 %	50 %	0 %	0 %	557624510
84	NC_022783	CTT	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624510
85	NC_022783	ACTT	2	8	5417	5424	25 %	50 %	0 %	25 %	557624510
86	NC_022783	T	6	6	5423	5428	0 %	100 %	0 %	0 %	557624510
87	NC_022783	TTTC	2	8	5447	5454	0 %	75 %	0 %	25 %	557624510
88	NC_022783	TGCA	2	8	5466	5473	25 %	25 %	25 %	25 %	557624510
89	NC_022783	TTTC	2	8	5489	5496	0 %	75 %	0 %	25 %	557624510
90	NC_022783	T	7	7	5507	5513	0 %	100 %	0 %	0 %	557624510
91	NC_022783	CTT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624510
92	NC_022783	TTC	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624510
93	NC_022783	CTA	3	9	5654	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624510
94	NC_022783	CTT	2	6	5663	5668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624510
95	NC_022783	T	6	6	5750	5755	0 %	100 %	0 %	0 %	557624510
96	NC_022783	CT	3	6	5803	5808	0 %	50 %	0 %	50 %	557624510
97	NC_022783	TTG	2	6	5811	5816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557624510
98	NC_022783	CAA	2	6	5846	5851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557624510
99	NC_022783	GTTT	2	8	5889	5896	0 %	75 %	25 %	0 %	557624510
100	NC_022783	T	6	6	5908	5913	0 %	100 %	0 %	0 %	557624510
101	NC_022783	TTTCTT	2	12	5942	5953	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	557624510
102	NC_022783	TTC	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624510
103	NC_022783	TGT	2	6	6142	6147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557624510
104	NC_022783	ACT	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624510
105	NC_022783	TCA	3	9	6238	6246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624510
106	NC_022783	CTT	2	6	6317	6322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624510
107	NC_022783	ATC	2	6	6399	6404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557624510
108	NC_022783	CTT	2	6	6479	6484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557624510
109	NC_022783	CTGG	2	8	6547	6554	0 %	25 %	50 %	25 %	557624510
110	NC_022783	GATT	2	8	6616	6623	25 %	50 %	25 %	0 %	557624510

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.